您的位置 首页 生物信息学

开发理性设计方法用于酶分子改造

发布: 2019-10-27 1,807阅读 281评论

【摘要】
定向进化和理性设计是两种常见的酶分子改造策略。定向进化策略已经被成功应用于酶活性、稳定性、底物特异性、立体选择性等性质的改造，并因此被授予了2018 年诺贝尔化学奖。然而，定向进化需要构建大规模的突变体文库，建立高通量筛选手段，并耗费大量的人力，物力以及财力。定向进化方法也难以完成对序列空间的全面搜索，存在根本缺陷。理性设计策略依靠对蛋白质结构与功能关系的认识预测可能的突变型，而后通过定点突变的手段在目的基因中构建突变型。从本质上说，与定向进化相比，理性设计改造蛋白质的效率更高。另外，理性设计方法具有普适性，一种有效理性设计策略可以普遍应用于多种蛋白质的改造。然而，目前理性设计方法的准确率普遍较低，应用范围远没有定向进化广泛。本人近年来从事开发理性设计方法用于酶的改造研究。在此次报告中，我将介绍自己取得的一些成果。具体包括：发展基于“柔性”的理性设计策略以提高酶稳定性[1-2]；利用分子动力学模拟探究长距离点突变之间相互作用机制[3]；以及开发理性设计策略克服酶分子活性与稳定性之间的“trade-off”[4]。

Reference:
[1]Haoran Yu,He Huang. “Engineering Proteins for Thermostabilitythrough Rigidifying Flexible Sites (RFS).” Biotechnology Advances 32.2 (2014):308-315.
[2]Haoran Yu, YihanYan, Cheng Zhang, Paul A. Dalby. “Two strategies to engineer flexible loops forimproved enzyme thermostability.” Scientific Reports 7, Article number: 41212(2017) doi:10.1038/srep41212.
[3] HaoranYu, Paul A. Dalby. “Coupled molecular dynamicsmediate long and short-range epistasis between mutations that affect stabilityand aggregation kinetics.” Proceedingsof the National Academy of Sciences 115, no. 47 (2018): E11043-E11052.
[4] HaoranYu, Paul A. Dalby. “Exploiting correlatedmolecular-dynamics networks to counteract enzyme activity-stability trade-off.”Proceedings of the National Academy ofSciences 115, no. 52 (2018): E12192-E12200.

1.16K赞
标签:



相关文章

发表回复

您的电子邮箱地址不会被公开。 必填项已用*标注

评论列表(281)

  2. You made some good points there. I checked on the net for more info about the issue and found most people will go along with your views on this site.

    7lrc.com

    回复

  4. Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали сервисный центр asus цены, можете посмотреть на сайте: срочный сервисный центр asus
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  5. Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали сервисный центр asus адреса, можете посмотреть на сайте: сервисный центр asus сервис
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  6. Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали ремонт телевизоров xiaomi цены, можете посмотреть на сайте: ремонт телевизоров xiaomi сервис
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  7. Ремонт телевизоров Xiaomi Москва说道：

    Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали ремонт телевизоров xiaomi адреса, можете посмотреть на сайте: ремонт телевизоров xiaomi рядом
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  18. Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали сервисный центр xiaomi в москве, можете посмотреть на сайте: сервисный центр xiaomi
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  33. Профессиональный сервисный центр по ремонту сотовых телефонов в Москве.
    Мы предлагаем: адрес ремонта смартфонов
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  34. Начните массовую индексацию ссылок в Google прямо cейчас!
    Быстрая индексация ссылок имеет ключевое значение для успеха вашего онлайн-бизнеса. Чем быстрее поисковые системы обнаружат и проиндексируют ваши ссылки, тем быстрее вы сможете привлечь новую аудиторию и повысить позиции вашего сайта в результатах поиска.
    Не теряйте времени! Начните пользоваться нашим сервисом для ускоренной индексации внешних ссылок в Google и Yandex. Зарегистрируйтесь сегодня и получите первые результаты уже завтра. Ваш успех в ваших руках!

    回复

  53. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервис центры бытовой техники воронеж
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  59. “Lookin’ good, son. Lookin’ good.” His dad says over the stream of the warm cleansing water as it caresses his mature man body.

    回复

  70. Профессиональный сервисный центр по ремонту сигвеев в Москве.
    Мы предлагаем: сервисный центр сигвей в москве
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  71. Ремонт сетевых хранилищ в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту сетевых хранилищ в Москве.
    Мы предлагаем: профессиональный ремонт сетевых хранилищ
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  72. I used my teeth to strip off daddy’s black sheer socks. I placed them in my mouth and washed them with my saliva. I swallowed every single sweat and stink from these socks. It takes so well. I rolled them into a ball and stuck them into my jockstrap where my small dick and balls were. “What happened at today’s practice today that was so different from any other day, son?” His dad asks.

    回复

  73. Профессиональный сервисный центр по ремонту серверов в Москве.
    Мы предлагаем: сколько длится обслуживание сервера
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  74. “Yeah, dad, it’s me.” He shouts over the blistering rush of the shower spray as it pelts him hotly with force. “It was a rough practice.” “I figured you did.” His father says. “You play on a team, so you know the purpose of teamwork.”

    回复

  76. Профессиональный сервисный центр по ремонту принтеров в Москве.
    Мы предлагаем: срочный ремонт принтеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  79. Ремонт посудомоечных машин в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту посудомоечных машин с выездом на дом в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт посудомоечных машин в москве недорого
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  80. Many thanks, I appreciate this.
    best vegas online casino io [url=https://usacasinomaster.com/#]new usa online casinos[/url] casumo online casino test

    回复

  81. Effectively voiced genuinely. !
    casino online играть бесплатно [url=https://luckyusaplay.com/#]casino free games online[/url] casino online betting sites

    回复

  82. Amazing loads of valuable information!
    casinos online paraguay [url=https://luckyusaplay.com/#]brand new online casinos usa no deposit bonus[/url] any online casinos that have backgammon

    回复

  83. His father loosens his grip on the full balls of his son as he stands. He can see the spurts of hair that dot the chest of his son. And he can see the heaving and gentle rise and fall of his son’s chest, as he breathes, as his excitement builds. [url=https://arturzasada.pl/]polskie porno[/url] “What?’ He balks at the suggestion from his dad.

    回复

  84. Профессиональный сервисный центр по ремонту моноблоков в Москве.
    Мы предлагаем: сервис ремонт моноблоков
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  85. Профессиональный сервисный центр по ремонту гироскутеров в Москве.
    Мы предлагаем: надежный сервис ремонта гироскутеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  90. Kudos. I enjoy it.
    casino online chile paypal [url=https://uscasinoguides.com/#]casino live online[/url] online casinos european

    回复

  92. Thanks a lot, Numerous postings.
    casino best online [url=https://usaplayerscasino.com/#]free casino online[/url] online casinos real money australia

    回复

  94. Regards. I appreciate it.
    best online casinos worldwide [url=https://usacasinomaster.com/#]best online casino welcome bonus no deposit[/url] mohegan online casino pa real money

    回复

  95. Профессиональный сервисный центр по ремонту компьютеров и ноутбуков в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт макбук про
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  97. You revealed it perfectly.
    best mobile casino online [url=https://luckyusaplay.com/#]casino online games[/url] las vegas casino games online free

    回复

  100. Truly loads of wonderful data!
    online casino lapalingo [url=https://usaplayerscasino.com/#]best online casinos that payout[/url] best online casino free spins bonus

    回复

  102. Many thanks, Plenty of data.
    miami dice casino online [url=https://usagamblinghub.com/#]casinos online usa[/url] mr green online casino review

    回复

  103. Regards. I value it.
    7clubs online casino [url=https://usacasinomaster.com/#]casino game online[/url] online casino first deposit

    回复

  106. This is nicely said! !
    no deposit free bonus online casino washington [url=https://luckyusaplay.com/#]bet online casino[/url] do online casinos ban winners

    回复

  111. Cheers! I value it!
    online casino room [url=https://uscasinoguides.com/#]best online casino no deposit bonus[/url] online casinos south carolina

    回复

  113. You said it superbly!
    online us casinos that accept paypal [url=https://usaplayerscasino.com/#]online live casinos[/url] river casino online

    回复

  114. Nicely spoken truly. !
    99 casino online [url=https://usagamblinghub.com/#]casino online casino[/url] club player online casino

    回复

  116. Really all kinds of awesome information.
    top fazi interactive online casino sites [url=https://usacasinomaster.com/#]casino play online[/url] greektown online casino michigan

    回复

  118. You said that adequately!
    vegas palms casino online [url=https://luckyusaplay.com/#]best online usa casinos[/url] casino baden online

    回复
  120. ремонт кондиционеров сервис центры в москве说道：

    [url=https://remont-kondicionerov-wik.ru]сервис кондиционеров[/url]

    回复

  122. You’ve made your point!
    stardust online casino nj [url=https://uscasinoguides.com/#]brand new online casinos usa no deposit bonus[/url] hard rock casino online pennsylvania

    回复

  124. Lovely data. Thanks.
    best online casino in new jersey [url=https://usaplayerscasino.com/#]casino free games online[/url] online casino 21

    回复

  125. You actually reported that effectively!
    best online casino companies [url=https://usagamblinghub.com/#]casino online games[/url] online casino illinois reddit

    回复

  126. Thank you. Lots of facts.
    game vault casino online real money [url=https://usacasinomaster.com/#]legit online casino[/url] seminole social casino online

    回复

  128. Thank you, Plenty of forum posts.
    list of online casinos in italy [url=https://luckyusaplay.com/#]best casinos online[/url] agen taruhan casino cbet online

    回复

  132. Whoa many of awesome information!
    new us online casino [url=https://usaplayerscasino.com/#]new online casino usa[/url] usa no deposit casinos online

    回复

  134. Information nicely taken!!
    mansion online casino ltd [url=https://usacasinomaster.com/#]online casinos for united states[/url] online live casino reviews

    回复

  135. Wow many of useful info!
    good online casinos canada [url=https://luckyusaplay.com/#]popular online casinos[/url] free online casino bets

    回复

  137. Профессиональный сервисный центр по ремонту парогенераторов в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт парогенератора цена
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  139. Truly a lot of very good information.
    best online casinos that pay [url=https://usacasinomaster.com/#]no deposit bonus online casino[/url] avalanche online casino

    回复

  141. Reliable facts. Thanks.
    online casinos au [url=https://luckyusaplay.com/#]best online casino sign up bonus[/url] luxury online casino

    回复

  143. Regards! Good stuff.
    die besten online casinos schweiz [url=https://uscasinoguides.com/#]casino online play free[/url] online casino poland

    回复

  144. You’ve made your point!
    free spins no deposit casino online [url=https://usaplayerscasino.com/#]online casinos usa[/url] gta online casino heist bugstars guide

    回复

  145. Если вы искали где отремонтировать сломаную технику, обратите внимание – [url=https://tyumen.profi-teh-remont.ru]ремонт цифровой техники тюмень[/url]

    回复

  146. Профессиональный сервисный центр по ремонту кнаручных часов от советских до швейцарских в Москве.
    Мы предлагаем: срочный ремонт часов
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  148. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервисные центры по ремонту техники в перми
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  149. Whoa a good deal of helpful info!
    new usa online casinos 2019 [url=https://usagamblinghub.com/#]most trusted online casinos for usa players[/url] online casino betus no deposit bonus

    回复

  152. Nicely put. Thanks!
    beste online casino spiele [url=https://usacasinomaster.com/#]best online casino mentor[/url] san manuel casino games online

    回复

  154. Whoa loads of superb facts!
    best usa online casinos 2020 [url=https://luckyusaplay.com/#]online usa casino[/url] new online real money casino

    回复

  156. Thanks a lot, Helpful information!
    online casino south africa legal [url=https://uscasinoguides.com/#]american casino online[/url] new malta online casino

    回复
  158. сервис центры в нижнем новгороде说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервисные центры по ремонту техники в нижнем новгороде
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  160. Ремонт камер видео наблюдения в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту камер видео наблюдения по Москве.
    Мы предлагаем: ремонт систем видеонаблюдения
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  161. Regards. Quite a lot of knowledge!
    michigan online casino reviews [url=https://usacasinomaster.com/#]online gambling casino[/url] online casino spanish

    回复

  162. With thanks, A lot of content.
    best canadian online casino 2022 [url=https://luckyusaplay.com/#]casino online games[/url] ocean casino online customer service

    回复

  168. <a href=”https://remont-kondicionerov-wik.ru”>кондиционер ремонт</a>

    回复
  169. ремонт бытовой техники в самаре说道：

    ремонт бытовой техники в самаре

    回复

  171. Недавно разбил экран своего телефона и обратился в этот сервисный центр. Ребята быстро и качественно починили устройство, теперь работает как новый. Очень рекомендую обратиться к ним за помощью. Вот ссылка на их сайт: telefon remont.

    回复
  172. Ремонт блоков питания в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту компьютерных блоков питания в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт источников питания
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  173. Недавно нашёл отличный интернет-магазин, где можно приобрести раковины и ванны для ванной комнаты. Они предлагают огромный выбор сантехники и аксессуаров, подходящих под любой интерьер и бюджет. Ассортимент действительно впечатляет: различные модели раковин (накладные, встроенные, подвесные) и ванн (акриловые, чугунные, гидромассажные).
    Особенно если вы ищете: купить раковину цена, что мне было очень нужно. Цены адекватные, качество товаров на высоте. Плюс, они предлагают профессиональные консультации, быструю доставку и услуги по установке. В общем, если кто-то ищет качественную сантехнику по хорошим ценам, рекомендую обратить внимание на этот магазин.

    回复

  176. Профессиональный сервисный центр по ремонту фото техники от зеркальных до цифровых фотоаппаратов.
    Мы предлагаем: ремонт проектора в москве
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  194. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервисные центры по ремонту техники в москве
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  230. Наша группа искусных исполнителей готова предъявить вам прогрессивные методы, которые не только ассигнуруют надежную покров от холодильности, но и подарят вашему домашнему пространству модный вид.
    Мы занимаемся с самыми современными материалами, подтверждая постоянный период работы и выдающиеся результирующие показатели. Теплоизоляция наружных поверхностей – это не только экономия на обогреве, но и ухаживание о экосистеме. Энергосберегающие технологические решения, какие мы применяем, способствуют не только своему, но и сохранению природных ресурсов.
    Самое главное: [url=https://ppu-prof.ru/]Утепление фасадов за 1 кв[/url] у нас стартует всего от 1250 рублей за метр квадратный! Это бюджетное решение, которое превратит ваш хаус в действительный тепличный уголок с небольшими затратами.
    Наши примеры – это не лишь изолирование, это разработка области, в где каждый элемент отражает ваш собственный моду. Мы рассмотрим все твои пожелания, чтобы осуществить ваш дом еще больше приятным и привлекательным.
    Подробнее на [url=https://ppu-prof.ru/]официальном сайте[/url]
    Не откладывайте труды о своем ларце на потом! Обращайтесь к профессионалам, и мы сделаем ваш дворец не только согретым, но и стильнее. Заинтересовались? Подробнее о наших работах вы можете узнать на интернет-портале. Добро пожаловать в обитель спокойствия и стандартов.

    回复

  279. Dear valued customer,

    We introduce ourselves as promoters of specialized business software, designed to enhance operational efficiency across various industry sectors. We are confident that our proposals can significantly contribute to the success of your business and your security .

    You can find further details and review one of our proposals at the following link
    https://bestqtf.my.canva.site/software-security-

    We remain at your disposal for any clarifications

    Best regards,
    Alessandro Molari

    Opt out of future messages by replying to the message and saying you opt out and entering your website domain.

    回复
联系我们

联系我们

(44)07934433023

在线咨询: QQ交谈

邮箱: info@bioengx.org

关注微信
微信扫一扫关注我们

微信扫一扫关注我们

关注微博
返回顶部