2020年，空间全转录组测序技术被Nature Methods评为年度技术方法；2021年，华大Stereom…
1. Bio3D的介绍 Bio3D 是一款依托于 R 语言的工具包，包含用于分析生物分子结构、序列和轨迹数据的…
用途 为Amber分子动力学模拟准备所需的拓扑和坐标文件。支持生物大分子、有机小分子体系，暂不支持膜蛋白。 预…
软件与材料 本文内容使用到如下软件： Ambertools 20 GROMACS 2019.5 Gaussia…
体系说明 本文主要针对蛋白配体模拟体系的预处理过程做一个简短的记录。体系中包含一个蛋白质，六个初始位置不同的配…
0. 引言 本文以前文为基础，对蛋白配体复合物分子模拟体系的结果进行一系列的粗浅分析，本文记述了简要的分析方法…
很早之前就看过关于参考基因组的资料来着，最近又忘得一干二净了，想整理笔记的时候看到了这篇很早之前的文章，于是决…
前言：昨晚听了师兄开的博客熊言熊语，印象最深的Jimmy, 以及徐洲更，果子的两期，顺带做了一枚DIY的发卡。…
前言 整理这个专题的缘由，是在朋友圈看到的求助信息。于是我想把我之前了解或者是做过的一些东西整理一下。 Q1:…
众所周知，在细胞膜或者膜结构上有很多跨膜蛋白，它们有些片段在细胞外，有些片段在细胞内，分别发挥着不同的功能。对…
作者: 刘源 北京大学化学与分子工程学院-王初题组特聘博士后 一、前言 去年CASP上AlphaFold打败了…
1 A:我设计的靶点化合物已经测完细胞活性，除了需要买蛋白回来测活性以外，还有没有什么替代的方法来验证活性? …
在使用殷赋云计算平台的时候，有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准…
以下是我司精选的微信群聊天记录，想加入微信学术交流群的朋友，请在公众号“殷赋科技”首页输入“加群”，验证后入群…
以下内容来自殷斌科技微信学术交流群。 1 A:一般虚拟筛选的小分子结合能低，docking分数很不错但实际活性…
摘要：晶体学，冷冻电镜以及NMR是传统蛋白结构研究的三座大山，而随着计算机蛋白模拟技术的迅猛进步，使得x-ra…
嘉宾：蒲中机 博士，大连理工大学 主持人：汤文 摘要： 酶作为理想的催化剂，显示出显著的反应速率、高立体化学和…
高通量测序结束之后，想要发表文章，除了要面对数据分析这一难题，还需要将测序数据上传至NCBI。 上传到NCBI…
前言 上一期，小编教大家使用殷赋云计算平台（http://cloud.yinfotek.com）重现了一篇20…
1. 分子对接(molecular-docking)理论 所谓分子对接就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量…
在分子克隆实验中，获取基因的全长开放读码框（ORF）有时候会是一个挑战。对于新手来说，这个实验有时候可以卡很久…
Warning:以下内容基于笔者本人使用的Win10操作系统编写。 前言 R语言是进行生物信息学数据分析工作的…
写在开头 本次推送的主要内容是R语言中常用参数的介绍和使用方法，也是较为基础的，更适合刚刚开始学习R语言的小萌…
信号通路作为细胞内活动的真实写照，素来都是分子机制研究的重头戏，因而无论是高分文章还是申请基金，都少不了要抱抱…
作为科学工作者和学习者，一旦提到统计作图，必然绕不开一种计算机语言——R语言。R作为一种用于统计分析、绘图的自…
蛋白质理化性质是蛋白质研究的基础，我们先来看看蛋白质的基本性质有哪些。 蛋白质的基本性质 相对分子质量 氨基酸…
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