您的位置 首页 合成生物学

Nat.Commun. | 嵌合体翻译系统的定向进化，可用于高效的整合非天然氨基酸以及营养缺陷型菌体的构建

发布: 2022-10-21 1,000阅读 205评论

2021年12月，浙江大学林世贤团队在Nature Communications发表题为“Directed-evolution of translation system for efficient unnatural amino acids incorporation and generalizable synthetic auxotroph construction”的文章。

该研究对嵌合体苯丙氨酸tRNA的受体臂和嵌合体苯丙氨酸氨酰-tRNA合成酶进行了系统的定向进化，极大地提高了含非天然氨基酸 (unnatural amino acids，UAA) 蛋白的产量（图1）。定向进化后的嵌合体翻译系统能够在模型蛋白的单点和多点允许UAAs以接近天然氨基酸的效率编码。利用嵌合体翻译系统，构建了一系列严格依赖外源UAA供应生长的大肠杆菌营养缺陷型菌株，研究进一步证明，该菌株可以在活体小鼠中茁壮生长。

图1 嵌合体翻译系统的工作原理与应用

以 WT（chPheT）为例（图2），研究人员首先对chPheT的受体臂的第2 ~ 7个碱基对开始系统的定向进化，碱基被随机分配到所有可能的组合中，生成约1.7 × 107个变体的文库，随后的tRNA文库经过一轮的正筛选（筛选1800个克隆），测序200个荧光信号明显强于WT组的克隆，结果显示，这些新进化的正交tRNA的受体臂有一些共同的特征，都使用U-A作为第二碱基对和G-C为第七对碱基对。最活跃的3C11-chPheT, 在AzF存在时活性增强6.3倍。

图2 chPheT的定向进化

苯丙氨酸氨酰-tRNA合成酶的定向进化采用了多轮易错PCR的方法，对AzFRS-1的C-末端结构域进行进化，13万多个克隆经4轮筛选最终获得了12D4-chPheRS和13E3-chPheRS两个优势克隆。

图3 chPheRS的定向进化

其中12D4-AzFRS-1的效率比前体chPheRS高6.2倍，13E3-AzFRS-1的效率高5.6倍，并且它们有几个共同的突变 (图3a)。这些突变都没有出现在氨基酸结合袋中，这表明这些突变可以转移到其他chPheRS中，从而有效地识别各种UAA (图3 b)。分析显示，12D4-chPheRS/3C11-chPheT对能够在蛋白的多个位置和多种功能蛋白质中以接近天然氨基酸的翻译效率编码多种非天然氨基酸（图4）。

图4 非天然氨基酸在多个位置和多种功能蛋白质中的引入

最后，该研究筛选了所有可用的chPheRS/3C11-chPheT对，找到了在AzF存在时琥珀密码子抑制效率提高了65倍以上的理想突变，成功构建了合成营养不良菌的理想系统（图5）。研究进一步证明，依赖于外源性 UAA 的体内供应，营养缺陷型菌株可以在活体小鼠中茁壮生长。进化的系统将极大地扩展我们生产功能蛋白、构建生物安全实验室菌株和减毒疫苗开发的能力。

图5 非天然氨基酸依赖的大肠杆菌的构建

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-021-27399-x

593赞
标签:



相关文章

发表回复

您的电子邮箱地址不会被公开。 必填项已用*标注

评论列表(205)

  5. Предлагаем услуги профессиональных инженеров офицальной мастерской.
    Еслли вы искали официальный сервисный центр xiaomi, можете посмотреть на сайте: официальный сервисный центр xiaomi
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  11. Профессиональный сервисный центр по ремонту духовых шкафов в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт терморегулятора духовки
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  17. Профессиональный сервисный центр по ремонту сотовых телефонов в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт ноутбуков в городе
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  19. Начните массовую индексацию ссылок в Google прямо cейчас!
    Быстрая индексация ссылок имеет ключевое значение для успеха вашего онлайн-бизнеса. Чем быстрее поисковые системы обнаружат и проиндексируют ваши ссылки, тем быстрее вы сможете привлечь новую аудиторию и повысить позиции вашего сайта в результатах поиска.
    Не теряйте времени! Начните пользоваться нашим сервисом для ускоренной индексации внешних ссылок в Google и Yandex. Зарегистрируйтесь сегодня и получите первые результаты уже завтра. Ваш успех в ваших руках!

    回复

  21. Профессиональный сервисный центр по ремонту сотовых телефонов в Москве.
    Мы предлагаем: где отремонтировать телефон
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  25. Ремонт автомагнитол в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту автомагнитол в Москве.
    Мы предлагаем: сервисные центры по ремонт автомагнитол
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  26. сео продвижение медицинских сайтов说道：

    Тут делают продвижение сео продвижение медицинского сайта seo медицина

    回复

  34. I used my teeth to strip off daddy’s black sheer socks. I placed them in my mouth and washed them with my saliva. I swallowed every single sweat and stink from these socks. It takes so well. I rolled them into a ball and stuck them into my jockstrap where my small dick and balls were.

    回复

  39. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервисные центры в воронеже
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  50. “Once you plant that cock of yours in some squirmy hole and empty those warm balls of yours into a moist wet hole. Then you are on your way to becoming a man, and only then will you, come-of-age. But it is only a step onto the winding pathway towards manhood. It is my job to teach you what it means to be a man.” His father stands as he finishes his sentence. Loosening his belt and pulling his shirt out from the tucked confines of his pants. “Do it!” His dad orders.

    回复

  51. Профессиональный сервисный центр по ремонту серверов в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт серверного оборудования
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  52. Профессиональный сервисный центр по ремонту плоттеров в Москве.
    Мы предлагаем: мастер по ремонту плоттеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  53. Ремонт посудомоечных машин в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту посудомоечных машин с выездом на дом в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт посудомоечных машин электролюкс в москве
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  54. Ремонт гироскутеров в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту гироскутеров в Москве.
    Мы предлагаем: замена батареи на гироскутере цена
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  55. His son bucks on the lid as he turns beet red from his carnal machinations. His dad’s cock does not curve like that of his son, it angles like a fishing rod looking for fish under rushing river waters, from the deep furry patch between the father’s legs.

    回复

  56. Thanks a lot! Lots of content!
    online casinos with free spins no deposit [url=https://usagamblinghub.com/#]online casino bitcoin[/url] best online casino gambling

    回复

  57. You revealed it superbly!
    versailles online casino [url=https://usacasinomaster.com/#]top 10 online casino[/url] online casinos real tavil

    回复

  58. You said it very well..
    live roulette online holland casino [url=https://luckyusaplay.com/#]best online casinos[/url] online casino adventskalender

    回复

  59. Excellent advice. With thanks!
    gran casino torrelodones online [url=https://luckyusaplay.com/#]best casino online[/url] online casino ohne lizenz

    回复

  60. Профессиональный сервисный центр по ремонту кондиционеров в Москве.
    Мы предлагаем: сервис центр кондиционеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  62. Хотите больше бонусов и привилегий? Обязательно ознакомьтесь с [url=https://www.gameawards.ru/article/1318/obnovleny-kotirovki-na-pobeditelya-the-international-2023/]промокоды на 1xbet[/url], которые помогут вам получить больше преимуществ при игре. Активируйте промокоды и получайте фрибеты, кешбэки и другие приятные сюрпризы.

    回复

  65. You made your point.
    neteller online casinos [url=https://uscasinoguides.com/#]casino bonus online[/url] oranje casino spelen online

    回复

  67. You actually expressed that really well!
    gta online how to win casino [url=https://usaplayerscasino.com/#]casino play online[/url] click2pay online casinos

    回复

  69. Thank you! Great stuff.
    best international casino online [url=https://usagamblinghub.com/#]free play online casino[/url] can you play real casino online

    回复

  70. Incredible tons of amazing info.
    online casinos for cash [url=https://usacasinomaster.com/#]casino games free online[/url] casino online quebec

    回复

  72. Useful write ups. Regards!
    free online casino poker [url=https://luckyusaplay.com/#]social casino online[/url] raging bull online casino instant play

    回复

  75. Very good facts, Many thanks!
    nuovi casino online italiani [url=https://usaplayerscasino.com/#]no deposit bonus online casinos[/url] a casino online

    回复

  77. Great material. Thank you!
    best kiwi online casino [url=https://usagamblinghub.com/#]play casino online free[/url] usa rtg online casinos

    回复

  79. You said it adequately..
    ny online casino real money [url=https://usacasinomaster.com/#]no deposit bonus online casino[/url] beste online casinos deutschland

    回复

  80. You mentioned this perfectly.
    online casino instant bitcoin withdrawal [url=https://luckyusaplay.com/#]online live casinos[/url] online casino bonus utan insättning

    回复

  82. [url=https://remont-kondicionerov-wik.ru]ремонт кондиционеров москва[/url]

    回复

  83. Kudos. Great information.
    beste online casino belgie [url=https://uscasinoguides.com/#]casino online[/url] how to win in casino gta online

    回复

  85. Fine postings. Thanks a lot.
    new online casinos australia 2019 no deposit [url=https://usaplayerscasino.com/#]casino live online[/url] casino online mx

    回复

  87. Lovely write ups. Thanks a lot!
    rich palms online casino [url=https://usagamblinghub.com/#]casino online games free[/url] new vegas casinos online

    回复

  88. This is nicely said. .
    new online casinos 2019 [url=https://usacasinomaster.com/#]best online us casinos[/url] alpha casino online

    回复

  89. ремонт бытовой техники самара

    回复

  90. Regards. I enjoy it!
    novo online casino [url=https://luckyusaplay.com/#]live dealer online casino[/url] best online casino for blackjack reddit

    回复

  93. You explained this wonderfully!
    lightning link real money online casino [url=https://uscasinoguides.com/#]new online casino usa ok[/url] winstar online casino real money

    回复

  95. Terrific postings. Regards!
    vip lounge online casino [url=https://usaplayerscasino.com/#]best online casino reddit no deposit bonus[/url] merkur spiele online casino echtgeld

    回复

  97. Kudos, A lot of knowledge!
    caesars online casino bonus [url=https://usagamblinghub.com/#]no deposit bonus online casino[/url] online casino with debit card

    回复

  98. Thank you, Wonderful information.
    book of ra online casino [url=https://usacasinomaster.com/#]online casino bonus no[/url] romania casino online

    回复

  99. You’ve made the point.
    roulette online spielen betway casino bonus [url=https://luckyusaplay.com/#]game casino online free[/url] slotzilla online casino

    回复
  100. Ремонт парогенераторов в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту парогенераторов в Москве.
    Мы предлагаем: парогенератор ремонт замена
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  103. Amazing tips. Kudos!
    online paying casinos [url=https://uscasinoguides.com/#]new online casino no deposit bonus[/url] best online casinos that payout usa

    回复

  105. Wonderful material. Appreciate it.
    alle merkur casinos online [url=https://usaplayerscasino.com/#]play casino online[/url] new vegas casino online $100 no deposit bonus codes 2022

    回复

  106. You suggested it very well!
    bedste online casino [url=https://usagamblinghub.com/#]best online usa casino[/url] bandar betting igkbet casino online

    回复

  109. Nicely put. Thanks a lot!
    casino online ohne einzahlung bonus [url=https://usacasinomaster.com/#]new usa online casinos real money[/url] online casino sites legit

    回复

  111. Amazing a lot of amazing knowledge!
    top real money online casinos [url=https://luckyusaplay.com/#]casino onlines[/url] online casino mit handyrechnung bezahlen schweiz

    回复

  114. Nicely put. Thanks a lot!
    top 10 real money online casinos [url=https://uscasinoguides.com/#]online gaming casino[/url] amsterdam casino online gratis

    回复

  116. Terrific information, Thanks a lot!
    buy online casino platform [url=https://usagamblinghub.com/#]free online games casino[/url] best neogames online casinos

    回复

  118. Если вы искали где отремонтировать сломаную технику, обратите внимание – [url=https://tyumen.profi-teh-remont.ru]ремонт цифровой техники тюмень[/url]

    回复

  119. Excellent info. Thanks a lot.
    top 5 online casinos canada [url=https://luckyusaplay.com/#]usa online casino[/url] eerlijkste online casino

    回复

  120. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: ремонт крупногабаритной техники в перми
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  121. You actually suggested this perfectly.
    hawk online casino [url=https://uscasinoguides.com/#]online casinos no deposit bonus[/url] newest us online real money casinos

    回复

  123. Kudos! A good amount of content.
    man wins online casino [url=https://usaplayerscasino.com/#]online casino with no deposit bonus[/url] gta online cheat engine casino

    回复

  125. You said that adequately.
    biggest payout online casino [url=https://usagamblinghub.com/#]online casino top rated[/url] consejos para jugar casino online

    回复
  127. ремонт бытовой техники в нижнем новгороде说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: ремонт крупногабаритной техники в нижнем новгороде
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  128. You revealed this effectively!
    parx online casino nj [url=https://usacasinomaster.com/#]casino online games free[/url] caesars online casino phone number

    回复

  130. Профессиональный сервисный центр по ремонту фото техники от зеркальных до цифровых фотоаппаратов.
    Мы предлагаем: проектор ремонт
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  131. Профессиональный сервисный центр по ремонту камер видео наблюдения по Москве.
    Мы предлагаем: ремонт систем видеонаблюдения
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  132. Thanks a lot, Loads of write ups!
    web slot casino online [url=https://luckyusaplay.com/#]best online casinos that payout[/url] best online casino referral bonus

    回复

  135. You actually revealed that really well!
    mgm online pa casino [url=https://usaplayerscasino.com/#]social casinos online[/url] online casino eu bonus code

    回复

  136. Профессиональный сервисный центр по ремонту компьютероной техники в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт стационарных компьютеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  137. Beneficial advice. Many thanks.
    casino royale full movie free online watch [url=https://usagamblinghub.com/#]online casino with no deposit bonus[/url] online casino same day payout

    回复

  138. Thank you. Lots of postings!
    007 casino royal online espaГ±ol [url=https://usacasinomaster.com/#]online casinos for united states[/url] guru casino online bono sin depГіsito

    回复

  139. You definitely made the point!
    online casino fl [url=https://luckyusaplay.com/#]american casino online[/url] gold strike online casino

    回复

  141. <a href=”https://remont-kondicionerov-wik.ru”>сколько стоит ремонт кондиционера</a>

    回复

  143. Мой телефон перестал заряжаться, и я не знал, что делать. По совету друга обратился в этот сервисный центр. Мастера быстро нашли проблему и устранили её. Теперь мой телефон снова в строю! Рекомендую всем: сервис починки телефонов москва.

    回复

  144. Хочу поделиться опытом покупки в одном интернет-магазине сантехники. Решил обновить ванную комнату и искал место, где можно найти широкий выбор раковин и ванн. Этот магазин приятно удивил своим ассортиментом и сервисом. Там есть всё: от классических чугунных ванн до современных акриловых моделей.

    Если вам нужна купить раковину в ванну , то это точно туда. Цены конкурентные, а качество товаров подтверждено сертификатами. Консультанты помогли с выбором, ответили на все вопросы. Доставка пришла вовремя, и установка прошла без проблем. Остался очень доволен покупкой и сервисом.

    回复
  145. Ремонт блоков питания в Москве说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту компьютерных блоков питания в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт блока питания цена
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复
  147. Ремонт персональных компьютеров说道：

    Профессиональный сервисный центр по ремонту компьютероной техники в Москве.
    Мы предлагаем: качественный ремонт компьютеров
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  149. Профессиональный сервисный центр по ремонту фототехники в Москве.
    Мы предлагаем: ремонт вспышек
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!
    Подробнее на сайте сервисного центра remont-vspyshek-realm.ru

    回复

  167. Если техника Amkodor требует профессионального ремонта, ознакомьтесь с возможностями наших сервисов по [url=https://forstwoof.ru]ремонт погрузчика амкодор[/url].

    回复

  168. Профессиональный сервисный центр по ремонту бытовой техники с выездом на дом.
    Мы предлагаем: сервисные центры по ремонту техники в москве
    Наши мастера оперативно устранят неисправности вашего устройства в сервисе или с выездом на дом!

    回复

  173. I cling on to listening to the news bulletin lecture about receiving boundless online grant applications so I have been looking around for the finest site to get one. Could you advise me please, where could i find some?

    https://youtu.be/SzGMawvpIzc

    回复

  174. I really enjoy looking through on this website, it contains wonderful articles. “And all the winds go sighing, For sweet things dying.” by Christina Georgina Rossetti.

    https://youtu.be/m0AeJGsYkz4

    回复
  176. * * * Get your Free Bitcoin: http://jandkprintinginc.com/upload/r83l36.php * * * hs=13e4c1c149ce8318a579f0f25bc4ea3a*说道：

    2tfx4h

    回复

  180. Hello! Someone in my Facebook group shared this website with us so I came to check it out. I’m definitely loving the information. I’m bookmarking and will be tweeting this to my followers! Fantastic blog and superb design and style.

    https://youtu.be/l0unplZ0rcQ

    回复

  182. Hi, I think your site might be having browser compatibility issues. When I look at your website in Safari, it looks fine but when opening in Internet Explorer, it has some overlapping. I just wanted to give you a quick heads up! Other then that, fantastic blog!

    https://youtu.be/5MByAPBSZeY

    回复

  183. It is in reality a nice and helpful piece of info. I¦m satisfied that you shared this useful info with us. Please stay us informed like this. Thanks for sharing.

    https://youtu.be/VKUPvmAMtQo

    回复

  184. I’m still learning from you, but I’m making my way to the top as well. I absolutely love reading everything that is posted on your website.Keep the aarticles coming. I liked it!

    https://youtu.be/qzuMYEA7ei0

    回复

  186. Thank you for sharing excellent informations. Your web site is so cool. I am impressed by the details that you have on this web site. It reveals how nicely you understand this subject. Bookmarked this website page, will come back for more articles. You, my friend, ROCK! I found just the information I already searched everywhere and just could not come across. What a perfect site.

    https://youtu.be/TusAgHtvLAM

    回复

  187. Nice post. I learn something more challenging on different blogs everyday. It will always be stimulating to read content from other writers and practice a little something from their store. I’d prefer to use some with the content on my blog whether you don’t mind. Natually I’ll give you a link on your web blog. Thanks for sharing.

    https://youtu.be/1pGIdNMgOZ0

    回复

  190. That is the correct blog for anyone who wants to seek out out about this topic. You notice so much its nearly onerous to argue with you (not that I actually would want…HaHa). You undoubtedly put a brand new spin on a topic thats been written about for years. Great stuff, just great!

    https://youtu.be/BjLaxcSH2Rs

    回复

  191. I want to show you one exclusive program called (BTC PROFIT SEARCH AND MINING PHRASES), which can make you a rich man!

    This program searches for Bitcoin wallets with a balance, and tries to find a secret phrase for them to get full access to the lost wallet!

    Run the program and wait, and in order to increase your chances, install the program on all computers available to you, at work, with your friends, with your relatives, you can also ask your classmates to use the program, so your chances will increase tenfold!
    Remember the more computers you use, the higher your chances of getting the treasure!

    DOWNLOAD FOR FREE

    Telegram:
    https://t.me/btc_profit_search

    回复

  194. Thank you for the sensible critique. Me & my neighbor were just preparing to do some research on this. We got a grab a book from our area library but I think I learned more clear from this post. I’m very glad to see such magnificent info being shared freely out there.

    https://keyaminototo.com/

    回复

  199. I love your blog.. very nice colors & theme. Did you create this website yourself? Plz reply back as I’m looking to create my own blog and would like to know wheere u got this from. thanks

    http://www.tlovertonet.com/

    回复

  200. When I originally commented I clicked the “Notify me when new comments are added” checkbox and now each time a comment is added I get several emails with the same comment. Is there any way you can remove me from that service? Thank you!

    http://www.tlovertonet.com/

    回复

  202. Преодолейте карьерный потолок с курсами дополнительного образования от нашего центра
    публикация материала на сайте [url=https://www.rokos-stolstul.ru]https://www.rokos-stolstul.ru[/url] .

    回复

  205. Wow, fantastic blog format! How lengthy have
    you ever been blogging for? you make running a blog look easy.
    The overall look of your site is wonderful, let alone the content material!

    You can see similar here ecommerce

    回复
联系我们

联系我们

(44)07934433023

在线咨询: QQ交谈

邮箱: info@bioengx.org

关注微信
微信扫一扫关注我们

微信扫一扫关注我们

关注微博
返回顶部